Genomics and Bioinformatics - An Introduction to Programming Tools for Life Scientists

WEB RESOURCES

 
Menu

About

What do people say about this book?

Download Perl scripts and other files referred to in the book

Bioinformatics resources : Databases

Bioinformatics resources : Software

Unix, Perl and R

Perl scripts from the book in Python version

Solutions to exercises

Typographical issues

Cambridge University Press

Typos A few strange things happened during the type-setting of the book. As a result, the codes 10.1 and 14.1 have the following errors:

Code 10.1 tax.pl

A piece reading:
SPECIES: @<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
COMMON:  ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
         ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
LINEAGE: ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
         ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
         ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
should read

SPECIES: @<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
          $species 
COMMON:  ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
          $common
         ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
          $common
LINEAGE: ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
          $lineage
         ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
          $lineage
	 ^<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< ~
          $lineage

Code 14.1 efetch.pl

A piece reading
  my $efetch = "?".
  "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?".
should read
  my $efetch = "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?".

Chapter 12, p. 150

Khrustalöv should be Khrustalëv

p. 313

print "row $i col $j = $matrix[$i][$j]\n"  should be 
print "row $i col $j = $matrix[$i][$j]\n";